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組織
（１）管理委員会・運営会議・専門委員会 　総合博物館は，研究・学術情報本部の施設として，館長のもとに総合博物館運営会議が運営の責任を持ち，この下位にある専門委員会が実際的な運営を行なう（図）。 運営会議　　　総合博物館の基本方針，主要な行事，予算・決算の決定などの事項を審議する。 専門委員会　　大学構内埋蔵文化財調査研究業務について審議する埋蔵文化財専門委員会のほか，例えば展示活動，データベース構築など，総合博物館諸業務の専門的事項に応じて設置し，館長，副館長，専任教員，兼任研究員などを中心に組織する。
組織図
（２）組織 館　　長　　総合博物館の業務を掌理する。 副 館 長 　　 館長を補佐し，総合博物館の業務を整理する。 専任教員　　総合博物館の専門的諸業務を遂行する。主要な業務の一つである本学の埋蔵文化財調査研究・修復保存に当たる「調査員」を兼ねる。 兼任研究員　それぞれの専門分野を生かして総合博物館の諸業務に携わる学内の兼務教員で，各専門委員会を構成する委員となる。 職　　員　　専任教員の指揮の下に，総合博物館諸業務の遂行を補助する。主要な業務の一つである本学の埋蔵文化財調査研究・修復保存に当たる「 調査補助員」を兼ねる。 　この他，必要に応じて学外協力研究員や市民・学生ボランティア組織などを置き，学内外の人材を活用する。
（３）スタッフ
■館　長 ■副館長 ■職　員 ■運営会議委員 ■兼任研究員	人文社会科学系　　（総合博物館）　　教　授 農生命科学系　　　（生物資源科学部）准教授 情報推進課 附属図書 館長 人文社会科学系　　（法文学部）　　　教　授 教育学系　　　　　（教育学部）　　　教　授 環境システム科学系（総合理工学部）　教　授 人文社会科学系　　（法文学部）　　　教　授 人文社会科学系　　（法文学部）　　　准教授 人文社会科学系　　（法文学部）　　　准教授 人文社会科学系　　（法文学部）　　　教　授 人文社会科学系　　（法文学部）　　　准教授 人文社会科学系　　（法文学部）　　　教　授 教育学系　　　　　（教育学部）　　　教　授 医学・看護学系　　（医学部）　　　　教　授 環境システム科学系（総合理工学部）　教　授 環境システム科学系（総合理工学部）　教　授		會下 和宏 石田 秀樹 田中 浩子 半田　真 佐々木 愛 長谷川 博史 入月 俊明 大橋 泰夫 岩本　崇 平郡 達哉 小林 准士 西田　兼 飯野 公央 作野 広和 橋本 龍樹 三瓶 良和 酒井 哲弥
■歴代館長・副館長	初代館長 第２代館長 第３代館長 第４代館長		高安 克己（平成18年4月～平成19年9月） 松野　煒（平成19年10月～平成21年9月） 林　正久（平成21年10月～平成26年3月）  入月 俊明（平成26年４月～令和５年３月）
	初代副館長 第２代副館長		渡邊 貞幸（平成18年4月～平成20年4月） 會下 和宏（平成20年５月～令和５年３月）